专项应付款的意思是指企业的专项资金对外发生的各种应付和暂收款项。专项应付款是企业接受国家拨入的具有专门用途的款项所形成的不需要以资产或增加其他负债偿还的负债。专项应付款的特点：1、属于企业的负债。2、专款专用。3、不需要以资产或新的负债偿还。
为了反映应付、暂收专用款项的增减变动，应设置“专项应付款”帐户组织核算。专项应付款或专项暂收款发生时贷记该帐户，支付各项应付、暂收款时，借记该帐户。贷方余额为专项应付款实有数。
在“专项应付款”帐户下，应按单位或个人设置明细帐户组织核算。在企业内部专项资金与流动资金相互垫支而发生的应付款项，直接通过“银行存款”和“专项存款”帐户划转，不在“专项应付款”帐户核算。
“专项应付款”账户用于核算企业接受国家拨入的具有专门用途的拨款，如专项用于技术改造、技术研究等，以及从其他来源取得的款项。在“专项应付款”账户下，应按专项应付款种类设置明细账，进行明细核算。