安徽蚌埠禹会区的自然资源有水、土地、森林、草原、野生生物、各种矿物和能源等，而且这些资源都十分丰富。
1.水资源
禹会区境内有天河、九里塘，西北边是千里淮河，水资源丰富。天河古称西濠水，位于禹会区区境，发源于凤阳山区西部武店东棺材山。
2.植物
禹会区常见乔木有140余种，包括：雪松、黑松、马尾松、火炬松(台大松)、獐子松等。还有常见的灌木有70多种，包括：麻叶绣线菊、李叶绣线菊、珍珠绣线菊等。以及常见的栽培植物200多种，比如：小麦、大麦、水稻、山芋、黄豆等。
3.动物
禹会区饲养的动物及鱼类主要有：马、黄牛、山羊等，还有饲养的昆虫蚕、蜜蜂，以及野生动物、昆虫有野兔、野鸡、獾、刺猬、黄鼬、豹猫等。